城址外北部、西部的台地上分布有不同历史时期的墓群，墓葬时代约为车师国及晋、唐时期（公元前2 世纪- 公元8 世纪）。其中沟北墓地为车师国贵族墓地，墓葬形制以竖穴墓为主， 现存墓葬7 5 座。沟西墓地包含车师国的竖穴墓、晋唐时期的斜坡墓道洞室墓。墓地依姓氏分别茔域，地面上用自然石块垒成茔墙和封隧的标帜。高昌至唐代的墓葬都是有墓道的洞室墓，墓内埋葬习俗与墓志风格多与晋唐之际的墓葬相同