大约在200多年前清雍正年间，俄合萨部落从同仁地区到现境。他们的祖先隆钦哀噶端米(121-1292年)，又称拉杰扎纳巴大师)是著名的瑜伽大师，他受萨迦班智连·贡噶俄合萨寺坚参(1216一1251年)的意旨，由西藏来到青海同仁地区兴教立业。清光绪二十四年(1898年)，俄合萨格西仓·嘉木样端雍大师(1878-1959年)依山修建了"修仙室"，创建了俄合萨寺。从此，这里便成为藏传佛教格鲁派"修行僧"刻苦修习的理想之地，同时也是海南藏族自治州境内，及至整个安多藏区唯一的常年闭关，昼夜修行，教规严明，风格独特的藏传佛教寺院。

俄合萨寺藏语称"俄合萨参木托乎扎喜伽系更徘香曲布林"，意为"俄合萨吉祥法寨兴善菩提洲"，简称"俄合萨寺"或"上寺"。由氏族部落名称得名。俄合萨寺主要由隆务龙伽三大家族(即嘉扎、洛哇、俄合萨族、瓦扎、加拉、美合浪族;大武、美仓、苟日族)为其香火部落。该寺在俄合萨格西仓·嘉木作端雍大师的主持下，始终限制财力的发展，反对积累财富。嘉木样端雍大师积极提倡艰苦朴素、简便从事的办寺原则，倡导僧人刻苦修行，诚心于佛。俄合萨寺在历史上规模不大，

1912年时，只有5位修行者，常年闭关修行，佛堂仅有3间。公元1912年以后，随着修行僧的增加为了满足当地信教群众的佛事需要，寺院规模有了一定的发展，至1958年，寺院共建有佛堂、小经堂、大经堂、弥勒佛殿、观世音菩萨殿、胜乐佛殿、护法殿、藏经院、印经院、转经轮尸林空行宫以及僧舍等建筑。然而由于该寺的特殊规定，寺院内始终没有大型的"活佛昂欠"。

无论活佛还是一般僧侣，都居住在普通的僧舍中，这是该寺的重要特征之一。寺内佛堂、小经堂和大经堂的建筑风格都是藏式建筑，树柳女墙，屋顶金瓦宝瓶，金光闪闪;弥勒佛殿、观世音菩萨殿是汉式建筑风格，金瓦屋顶，树柳女墙，屋顶祥麟法轮，光彩夺目。佛殿和经堂内供有大量的佛像、佛塔、佛经、佛灯以及各种法器供物。

公堂为二层建筑，上楼为餐厅，下楼为伙房，全寺所有僧众，包括活佛都在此用餐。

尸林空行宫，即为天葬场，位于寺院左侧山坡，由俄合萨格西仓·嘉木样端雍大师亲自创建。曾先后由嘉木样端雍大师、阿饶仓·洛桑隆道丹贝坚参大师、罗藏沃赛尔大师、俄合萨、堪布仓大师和宗万仓大师等诸多佛门名师予以加持，即用佛力护佑众生，俄合萨寺尸林空行宫常年由固定的僧人守护，每当送来一具尸体，首先由尸林主按着一定的宗教仪式予以加持，然后把尸体连肉带骨切成若干份之后就呼叫"神鸟"(即雄鹰)。"神鸟"非常有秩序地落下，不挤不抢，分食着由尸林主分发的份，食后依次飞向天空，缓缓人云，它象征着这个人升入了"天堂"。

俄合萨寺1958年，俄合萨寺遭到封闭，所有建筑被拆毁。1982年，在牟什党金刚大师的主持下，俄合萨寺重新开放。1983-1985年先后重建了小经堂、大经堂和菩提塔，胜乐佛殿以及14座佛塔。小经堂内供千手千眼观世音菩萨塑像和3尊长寿佛和俄合萨格西仓·嘉木样端雍大师银制灵塔。胜乐佛殿内供胜乐金刚佛、观世音菩萨、那若空行佛。大经堂建筑宏伟，为二层楼式，藏式屋顶，树柳女墙，金瓦宝瓶，殿内共有81个大柱子，其中有八大通天柱，内供佛3座佛塔和《甘珠尔》、《丹珠尔》、《宗喀巴师徒三人全集》等佛经。

俄合萨格西仓·嘉木样端雍大师少时在赛勒亥寺由阿饶仓大师受戒出家，长期修行，他在拉加寺拜师学经，获得"格西"学位，一生中著有文集五部。嘉木样端雍大师常年闭关修行，生活检朴，除了仅容纳自身的"修行室"外，没有扩建私房或"昂欠"，没有积累任何私有财产。他制定了一套严格的寺规，这是俄合萨寺与其他格鲁派寺院突出的不同处。