孔庄遗址位于河南省驻马店市驿城区水屯镇孔庄西南，小草河从遗址南部边缘经过汇入宿鸭湖，南距练江河2公里，南部有水泥路向西通到京珠高速南引线，南有新阳高速，西南是小李庄，东边紧邻孔庄。遗址平面近长方形，呈南北向分布，南部较高，北部较平缓，南北长约355米，东西宽近300米，总面积约10.65万平方米。文化层深2米左右，地表散落大量陶片。

发现有灰坑、房基、灶坑等重要遗迹和大量红烧土。采集标本有陶片和石器，陶片质地多样，有泥质、夹砂、夹蚌及磨光等；陶色丰富，有红、黑、灰、棕黄等色；纹饰多为素面，兼有篮纹、弦纹，可辨器形有白衣红、黑彩陶罐、宽扁式鼎足等。生产生活工具有石斧、石镞、陶纺轮等。内涵包含仰韶文化、屈家岭文化、石家河文化及龙山文化的典型器物，是一处新石器时期仰韶文化、龙山文化的聚落遗址。

遗址中发现的房基、灰坑等遗迹，为研究新石器时期豫南地区的聚落布局、居住形式以及人们的生活方式等提供了重要依据，有助于了解当时人们如何组织居住空间、进行生产生活活动。包含多种文化类型的典型器物，清晰地展示了不同时期文化在该地区的传承与演变，对于构建豫南地区新石器时代文化序列，研究各文化之间的相互关系、交流融合过程具有关键作用。融合了多种文化因素，体现了新石器时代豫南地区文化的多元性和包容性，反映了当时该地区处于不同文化交流的前沿地带，是不同文化相互碰撞、交流、融合的重要见证。