江南运河嘉兴－杭州段北起苏州与嘉兴交界处，南至杭州钱塘江边，是江南运河联系太湖水系与钱塘江水系的河道，从北至南包括始建于不同历史时期的苏州塘、杭州塘、崇长港、上塘河、杭州中河、龙山河等多段河道。江南运河嘉兴－杭州段始建于春秋时期（公元前5世纪）。公元7世纪初期（隋代）在前代开凿的运河基础上疏浚加深而成，作为江南运河南段实现了大运河全线贯通。公元10～11世纪时（宋代时期）又在大运河与钱塘江交汇处开龙山河等河段，完善钱塘江运口。其中，苏州塘、杭州塘北段始凿于汉代，全线贯通于隋代，现为运河主河道，大部分经升级拓宽改造以适应现代航运的要求。杭州塘南段开凿于元末，为运河主河道，基本保持原有线位，现为4级航道。南浔颇塘镇段基本保存原有尺度，保存状况较好。苏州塘、杭州塘为现今江南运河浙江段东线，长132公里，现为4级航道。上塘河、崇长港为江南运河浙江段故道，隋唐至元末作为运河主航道，源自杭州施家桥，向东北至海宁崇福接东线主航道。其中上塘河为“三塘五坝”之一，前身为秦始皇开辟的陵水道之一段，崇长港前身为春秋时期的百尺渎、越水道。上塘河、崇长港长46.5公里，河道平均宽30～70米，现为6级航道，主要功能转为水利行洪。杭州中河南北纵贯杭州城区中部，南接龙山河，水流方向由南向北汇入上塘河，现为城市景观河道。龙山河原是中河通钱塘江的水道。始凿于吴越钱镠时。宋代，龙山河由西向东北，由南水城门入城。清代末期，龙山河起自兴家桥，至大通桥外的闸口，水流由北向南，经龙山闸注入钱塘江。龙山河现南起闸口，北至凤山门，连接中河，全长4400米，与钱塘江已不相通，现为城市景观河道。时至今日，江南运河嘉兴－杭州段仍作为长江三角洲地区重要的航运通道不断维护，在漕运结束后仍保持了航运功能，至今还是江南地区重要的内河航道。2011年此段运河货运量就达到1.15亿吨。