当地原来的地名叫“阿克塔什”，含义是“白石头”；后来沿用的“三个泉子”乃是汉语地名，因在沟内有一年四季从不枯竭的三个泉眼而得名。驿站遗址位于新疆维吾尔自治区昌吉回族自治州木垒哈萨克自治县博斯坦乡三个泉子村南0.8千米的公路两侧。地处三个泉子沟谷东岸，地势较为平坦，谷地内现有泉水汇集成的小溪自南向北流淌。南面为山前丘陵，北为戈壁，地表多黄土沙粒，有少量耐早灌木。东南—西北向有木（垒）巴（里坤）公路从遗址内贯穿而过，南、北各有废弃的坎儿井贯通。东侧有十余家居民，南面台地上有一片耕地，西边是牧民的草场。东距沙河子驿站遗址16千米，西距一碗泉烽燧19千米。

驿站仅倒塌房屋的墙基依稀可辨，其余不存。驿站南北350米、东西331米，面积116 533平方米。墙基共分12个长方形单元，大小不等。大者长50米、宽40米，小者长25米、宽20米。第二次全国文物普查资料记载，房屋基址可清晰辨明房舍、棚圈、门道等遗迹。墙基现均为土垄状，黄色沙土构筑，宽1～2米、残高0.5～1米，部分断面露出夯土墙或石砌墙壁。遗址内地表散布黑釉陶片、灰色兽头瓦当残片等遗物，均为清代常见的生活用具和建筑材料。

作为古丝绸之路北道沿线的驿站，三个泉子驿站为保障西域边疆的往来发挥了重要的作用。